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自幼學習潮曲，因聲線優美，五十年代被引薦入新天彩潮劇團學戲，習演花旦，入師門嘅時間比鄭楚香同陳楚蕙更早。早年佢曾為粵語片做潮語配音。東海影業公司出品、香港攝製嘅首部潮語戲曲片《劉明珠三審玉芝蘭》（1960），佢已任女主角，夥拍女小生莊雪娟，由此奠定咗佢喺潮語戲曲片嘅重要花旦地位。之後陸續演出東山影業公司嘅《雙珠鳳》（1961）、東山潮音劇藝社嘅《蘇六娘》（1961）同中藝影業公司嘅《女駙馬》（1961）；喺萬聲電影製片公司嘅《掃窗會》（1961）中首度同新天彩出身嘅陳楚蕙合作。1961年1月底佢正式簽約東山影業，作品有《郭子儀賀壽》（1961）、《藍繼子哭街》（1961）、《八寶公主追夫》（1962）、《滴水記》（1962）、《雙退婚》（1962）同《瓊花淚》（1962）等近二十部，同莊雪娟成為長期嘅生旦組合，亦偶然同盧淑娟、李綠絨、金英等女小生合作，同丁楚翹同為東山嘅台柱花旦。1963年佢減少演出東山出品，只演咗武俠片《俠侶情仇》同《龍虎群英會》，以及東山同邵氏兄弟（香港）有限公司合作嘅彩色寬銀幕片《文武香球》。同年由聯友製片公司嘅《紅鬃烈馬》開始，佢返回新天彩潮劇團，展開長期合作，參演新天彩為聯友、潮藝同萬聲演出嘅潮語片，包括《孟麗君》（1963）、《元宵案》（1964）、《萬里尋夫骨》（1964）、《芙蓉仙子》（1964）、《共傘奇緣》（1965）、《奇雙會》（1965）、《洛神》（1966）、《三反獄》（1967）、《火燒碧雲宮》（1967）同《崔鳴鳳晉袈裟》（上、下集，1968）等，同新天彩台柱女小生陳楚蕙成為成功嘅生旦組合。方巧玉演過嘅潮語片達四十多部，以聲線佳、唱工出色聞名，有潮劇「萬能旦后」嘅稱譽。潮語片停產後，佢曾隨新天彩潮劇團到新加坡同泰國演出，1971年亦同莊雪娟喺香港作慈善演出。佢家翁李丙坤係樂聲潮劇團班主；方巧玉已退下舞台多年。